Služba za zdravstvenu ekologiju provodi mjere zaštite zdravlja ljudi kroz praćenje, analizu i ocjenu utjecaja okoliša na zdravlje. Svoju djelatnost provodi putem ispitivanja zdravstvene ispravnosti i kvalitete uzoraka voda (vode za piće, otpadne, površinske, podzemne i vode za kupanje), hrane, predmeta opće uporabe i mikrobiološke čistoće objekata.

Služba za zdravstvenu ekologiju obavlja svoju djelatnost u skladu s dobrom laboratorijskom praksom te zahtjevima Norme HRN EN ISO/IEC 17025:2007 prema kojoj je akreditirana za područje Ispitivanje voda. Akreditirane metode navedene su u prilogu Potvrda o akreditaciji broj 1260 od 25.11.2011.

Djelatnici Službe su stručnjaci iz područja svog djelovanja te sudjeluju u kreiranju javnozdravstvene politike na području Županije. Kvalitetan i stručan rad na području utjecaja čimbenika okoliša na zdravlje stanovnika omogućuje i korištenje visokosofisticirane opreme (AAS, IC, GC, HPLC i TOC/TN) sukladno hrvatskim propisima i europskim normama.