Služba za zdravstvenu ekologiju provodi mjere zaštite zdravlja ljudi kroz praćenje, analizu i ocjenu utjecaja okoliša na zdravlje. Svoju djelatnost provodi putem ispitivanja zdravstvene ispravnosti i kvalitete uzoraka voda (vode za piće, otpadne, površinske, podzemne i vode za kupanje), namirnica, predmeta opće uporabe i zraka. Za sva ispitivanja Služba je ovlaštena od nadležnih ministarstava:

• Ministarstvo zdravstva i socijalne skrbi Republike Hrvatske za osnovnu i specijaliziranu djelatnost zdravstvene ispravnosti namirnica i predmeta opće uporabe.
• Ministarstvo regionalnog razvoja, šumarstva i vodnoga gospodarstva za obavljanje ispitivanja otpadnih i površinskih voda.
• Ministarstvo zaštite okoliša, prostornog uređenja i graditeljstva za obavljanje stručnih poslova praćenja kakvoće zraka i emisija u zrak te stručnih poslova zaštite okoliša u vezi s praćenjem stanja atmosfere i hidrosfere kao sastavnica okoliša (monitoring atmosfere i hidrosfere).

Služba za zdravstvenu ekologiju obavlja svoju djelatnost u skladu s dobrom laboratorijskom praksom te prema zahtjevima Norme HRN EN ISO/IEC 17025 iz 2007.
Djelatnici Službe su stručnjaci iz područja svog djelovanja te sudjeluju u kreiranju javnozdravstvene politike na području Županije. Kvalitetan i stručan rad na području utjecaja čimbenika okoliša na zdravlje stanovnika omogućuje i korištenje visokosofisticirane opreme, sukladno hrvatskim propisima i europskim normama kao što su: IC, HPLC, AAS i GC.